Conforme publicação do Tribunal de Contas do Estado da Bahia, o órgão desaprovou as contas da UFBA relativas ao período de 2007 a 2010 que tinha como responsável o ex-reitor, Naomar Monteiro Filho, hoje, reitor da Universidade Federal do Sul da Bahia, que também foi punido com a multa de R$ 3.000,00 reais. A desaprovação das contas de Naomar foi em decorrência de um convênio entre o CRA e a Universidade.